Dirección: Plaza 5 de Mayo

Se localiza donde antes radicó la estación del ferrocarril interoceánico de Panamá y el edificio comenzó a construirse en 1912, pero pasó a convertirse en museo a partir de 1976.

Se han expuesto, entre otras, obras maestras de la orfebrería precolombina panameña, así como piezas que han sido excavadas científicamente y de las que se dispone de referencias arqueológicas. En este grupo destaca la pieza de metal más antigua de Centroamérica.

Como atractivo se ofrecen permanentemente exhibiciones temporales entre ellas la de cerámica policroma temprana de la región central y la titulada Los rostros de los antepasados.

Resulta de excepcional valor histórico la inmensa mayoría de los tomos que atesora la Biblioteca especializada en prehistoria, arqueología, antropología y temas afines, en tanto el Auditorio que dispone la institución puede ser empleado para disímiles actividades.